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新的DNA扫描方法可以更快地诊断癌症和罕见疾病

了解人类DNA的序列可以为科学家提供有关疾病的信息,包括潜在地如何诊断或治疗疾病。在《自然生物技术》上发表的一篇新论文中,该大学生命科学学院的科学家表明,现在可以比以前更快,更经济地选择DNA片段的序列,而无需搜索与DNA无关的DNA链。生物问题,比以往更快地得到答案。

这可能对诊断遗传病的方式产生重大影响。

该大学生命科学学院的DeepSeq测序设施的Matt Loose教授领导了这个项目。他说:“简单来说,我们现在可以对我们想要的DNA位进行测序,而忽略我们不需要的位。我们在这里取得的进步意味着我们可以从基因组中搜索甚至对与人类基因组一样大的区域进行测序。 。”

这项新研究显示了该团队现在如何能够快速扫描人类基因组,并在便携式DNA测序仪MinION上检测基因异常。他们通过在不到15小时内定位导致特定类型癌症的DNA的变化来说明这一点。人类基因组有30亿个数据点,典型的全基因组分析可能需要几天的时间。因此,该团队表明,该方法现在可以用于高速“扫描”基因组,以查看是否存在明显的问题,而不必对整个基因组进行测序,也无需执行复杂的实验室过程来选择感兴趣的基因组区域。

该团队开发了一种称为ReadFish的新选择性方法,该方法允许DNA测序仪针对特定问题只选择人类基因组(或任何基因组)的那些区域,因此只需要使用一次测序即可。

罗斯教授继续说道:“这项突破将使我们能够研究一系列应用,例如快速搜索人类基因组的片段,以找到可能导致癌症等疾病的遗传条件或变化的证据,这将对癌症产生重大影响。诊断。

“我们已经看到人们首次使用这种方法来识别许多不同个体中疾病的根本原因*。”

该研究的主要作者亚历山大·佩恩(Alexander Payne)表示:“拥有真正的自适应测序,可以随着实验的进行而做出响应,为定制和调整您所遇到的问题的测序带来了许多激动人心的机会。我非常期待看到ReadFish如何被纳米孔社区使用。”

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