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研究人员创建框架以帮助确定癌症突变的时机

加州大学洛杉矶分校强森综合癌症中心研究癌症发展的研究人员创建了一个框架,以帮助确定哪种工具组合最适合准确指出癌症基因组中DNA突变的确切时间。目前,研究人员开发了许多不同的算法来帮助确定突变的时机,但是直到现在,还不清楚哪种算法最适合哪种癌症,以及哪些常见偏见会影响其结果。

背景

癌症是基因组疾病。随着癌症的发展,其DNA不断获得新的突变,癌细胞的数量也在不断发展。了解发生的变化的顺序可以使研究人员研究癌症随时间的演变,并观察癌细胞群体如何多样化或变得更加统一。癌细胞群的多样性或均匀性与患者对治疗的反应有关,并揭示了可用于创建高度靶向治疗的漏洞。

方法

这项研究评估了22条不同的途径,用于癌症基因组中的时间突变。研究人员在近300个临床前列腺癌样本队列中测试了该算法,以评估每个流程,并观察其结果在各个方面有何不同。这样一来,团队就可以看到各种工具之间的差异性,并且可以公正地了解每种工具的执行方式。

影响

了解肿瘤何时以及为何转移或扩散到身体的其他部位,可能会影响癌症患者的治疗方式。该研究中开发的框架可以帮助研究人员确定哪种工具最适合他们的情况,并为患者生成更具个性化和针对性的治疗计划,从而最大程度地减少将来癌症复发的风险。

作者

资深作者是保罗·布特罗斯(Paul Boutros)博士,加州大学洛杉矶分校戴维·格芬医学院的泌尿学和人类遗传学教授,曾任加州大学洛杉矶分校精密健康研究所癌症信息学副主任和约翰逊癌症研究所癌症数据科学主任中央。第一作者是多伦多大学的博士候选人,加州大学洛杉矶分校的客座研究员Lydia Liu,由多伦多大学的托马斯·基斯林格博士和加州大学洛杉矶分校的布特罗斯博士共同指导。

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