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来自多人群数据的多基因风险评分可以改善IBD预测

西奈山的研究人员利用来自将近30,000人的遗传数据,建立了代表不同祖先群体的数据集的风险评分,这些数据集提高了对炎症性肠病(IBD)风险的预测,包括克罗恩病和溃疡性结肠炎。该研究于12月24日发表在胃肠病学杂志上。

研究人员发现,利用来自西奈山多民族的BioMe Biobank中多个种群的关联数据建立的多基因风险评分,可以最大化该生物库中每个种群的IBD预测。BioMe是西奈山的全系统性工作,正在根据患者的分子概况彻底改变疾病的诊断和分类。

该研究表明,通过整合数据计算出的风险评分显着改善了BioMe中具有欧洲,阿什肯纳兹犹太裔和西班牙裔血统的个人以及英国生物银行中的欧洲个体的预测,该个人包含了年龄在50万之间的生物和医学数据40和69岁居住在英国。非洲血统患者的预测能力较低,这可能是由于非洲血统的参考数据集大大减少以及遗传多样性大大增加所致。

在考虑和制定早期干预措施甚至预防措施的过程中,准确预测个体祖先的遗传疾病风险的能力是可能会积极影响患者预后的关键途径。这些发现支持需要更大的遗传多样性,包括更多有关非裔美国人人口的数据,以增强疾病风险预测并减少所有人口的健康差异。”

Judy H. Cho,医学博士,Audy的资深作者,转化遗传学系主任,西奈山伊坎医学院查尔斯·布朗夫曼个性化医学研究所所长

这些多基因风险评分-代表基于个体许多常见遗传变异的总和来评估整体风险-使用来自欧洲,非裔美国人和阿什肯纳兹犹太背景的队列中的IBD关联数据计算得出。

此外,研究人员评估了每个人群中与极早发作的IBD相关的基因中的稀有变异,发现非裔LRBA变异的非裔美国携带者显示LRBA和CTLA-4蛋白的表达均降低。LRBA缺乏症会增加对IBD的易感性,并导致CTLA-4表达降低,这可以通过通常处方的抗疟药氯喹逆转。Cho实验室未来的研究将集中于预测哪些患者子集可从靶向该途径中受益。

该研究的第一作者,伊坎医学院遗传与基因组科学系博士后凯尔·盖特勒(Kyle Gettler)博士说:“由于降低的LRBA和CTLA-4表达可能导致IBD,这令人鼓舞,氯喹能够部分恢复表达。”西奈山医学院。

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